View Artikel Ilmiah
Kembali| NIM (Student Number) | B1J012055 |
|---|---|
| Nama Mahasiswa | RISA |
| Judul Artikel | KERAGAMAN ISOLAT ACTINOMYCETES PENGHAMBAT Staphylococcus aureus BERDASARKAN ANALISIS MULTIPLEX PCR TERHADAP GEN NRPS DAN PKS |
| Abstrak | Staphylococcus aureus merupakan salah satu bakteri penyebab infeksi pada kulit.Meningkatnya multiresistensi S.aureus terhadap penggunaan antibiotik, mendorong usaha untuk mendapatkan sumber antibiotik baru. Senyawa antibiotik dapat dihasilkan oleh actinomycetes, bakteri, dan jamur. Actinomycetes merupakan salah satu jenis mikroorganisme yang sangat penting sebagai penghasil senyawa aktif. Penelitian ini bertujuan mengetahui keragaman isolat potensial penghambat Staphylococcus aureus berdasarkan analisis Multiplex Polymerase Chain Reaction (PCR) terhadap gen Non Ribosomal Peptide Synthetase (NRPS ) dan Polyketide Synthetase (PKS). Data yang didapatkan dianalisis dengan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmatic Average (UPGMA) program Molecular Evolutionary Genetic Analysis(MEGA)6.0. Sampel yang digunakan adalah tanah dari berbagai tempat, yaitu Laut Cilacap dan limbah Rumah Sakit Banyumas serta Rumah Sakit Margono Soekarjo. Hasil isolasi diperoleh 15 isolat dan isolat yang mampu menghambat S. aureus adalah isolat SB3, SW4, dan PT1. Jarak genetik terkecil terhadap gen NRPS terdapat pada SW4 dan PT1 dengan nilai 20,0%, sedangkan jarak genetik terbesar terdapat pada SB3 dan SW4 dengan nilai 50,0%, serta , serta pada SB3 dan PT1 dengan nilai 50,0%. Jarak genetik terkecil terhadap gen PKS terdapat pada SW4 dan SB3 dengan nilai 33,3%, sedangkan jarak genetik terbesar terdapat pada SW4 dan PT1 dengan nilai 55,6%. Analisis klaster hasil dendogram terhadap gen NRPS, isolat actinomycetes dapat dikelompokkan menjadi 2 kelompok yaitu Kelompok 1 (SW4 dan PT 1) dan kelompok 2 (SB3). Hasil dendogram analisis klaster terhadap gen PKS, isolat actinomycetes dapat dikelompokkan menjadi 2 kelompok yaitu Kelompok 1 (SW4 dan SB3), serta kelompok 2 (PT1). |
| Abstrak (Inggris) | Staphylococcus aureus is any of the bacteria the causes of infection on the skin.The multiresistensi s.aureus on the use of antibiotics, encourage the attempt to get new antibiotic. Antibiotic compounds can be produced by the actinomycetes , bacteria , and fungi.Actinomycetes is one type of microorganisms very important as producer active compound. This study aims to determine of potential isolates actinomycetes by Multiplex Polymerase Chain Reaction (PCR) analysis of Non Ribosomal Peptide Synthetase (NRPS) and Polyketide Synthetase (PKS) gene.NRPS and PKS gene amplification was conducted using multiplex PCR method. The results of subsequent PCR identified the existence of DNA by gel electrophoresis, amplicon have a diverse sizes. The data obtained were analyzed by the Unweighted Pair Group Method of Arithmatic Average (UPGMA) method of Molecular Evolutionary Genetic Analysis (MEGA) 6.0 programe. The smallest genetic distances towards the NRPS genes present on SW4 and PT1 with value of 20%, while the largest genetic distance found on SB3 and SW4 50% value, as well as SB3 and PT1 with value 50%..The smallest genetic distances towards the PKS gene present on SW4 and SB3 with value genetic distance 33,3%, while the largest genetic distance found on SW4 and PT1 with value 55,6%. The result of cluster analysis against the NRPS genes, isolates actinomycetes clumped into 2 groups, Group 1 (SW4 and PT 1) and Group 2 (SB3). The results of cluster analysis against the PKS genest, isolates actinomycetes clumped into 2 groups, Group 1 (SW4 and SB3), as well as Group 2 (PT1). |
| Kata Kunci | Actinomycetes, Gen NRPS dan PKS, Multiplex PCR, dan Staphyllococcus aureus |
| Nama Pembimbing 1 | Saefuddin Aziz, S.Si., M.Si |
| Nama Pembimbing 2 | Dra. Dini Ryandini, M.Si |
| Tahun | 2016 |
| Jumlah Halaman | 10 |
Page generated in 0.0663 seconds.