View Artikel Ilmiah
KembaliNIM (Student Number) | H1H013011 |
---|---|
Nama Mahasiswa | NAUFAL ABDUR ROZIQ |
Judul Artikel | IDENTIFIKASI MOLEKULER BAKTERI PENYEBAB NODUL PUTIH PADA ORGAN DALAM GURAMI (Osphronemus gouramy) DENGAN AMPLIFIKASI GEN HSP65 |
Abstrak | Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui spesifik bakteri pathogen penyebab nodul putih pada organ dalam gurami (Osphronemus gouramy) menggunakan identifikasi molekuler berdasarkan sekuen gen hsp65. Penelitian ini meliputi beberapa tahap yaitu pengumpulan sampel dari kelompok pembudidaya ikan Mina Ngudi Mulya Banjarnegara, pengumpulan jaringan ginjal dan hati, isolasi DNA, amplifikasi gen hsp65 menggunakan primer Tb11 dan Tb12, elektroforesis dan visualisasi hasil dengan UV-transilluminator serta sekuensing. Hasil amplifikasi menunjukkan pita DNA spesifik dengan panjang 441 bp. Hasil amplifikasi berhasil disekuensing. Sekuen dianalisis menggunakan BLAST dan analisis filogenetik. Hasil menunjukkan similaritas 100% dengan sekuen gen hsp65 Nocardia seriolae (DQ431454.1), dan 93-99% dengan spesies Nocardia lainnya. Hasil filogenetik menunjukan bakteri pathogen yang diteliti dalam penelitian merupakan spesies Nocardia seriolae. |
Abstrak (Inggris) | The Aim of this research was to know species of a pathogenic bacteria caused white nodule on gouramy (Osphronemus gouramy) using molecular identification based on hsp65 gene sequence. This research covered several stage that was collection of sample from group of fish farmers Mina Ngudi Mulya Banjarnegara, collection of kidney and liver tissue, DNA isolation, amplification hsp65 gene using primer Tb11 and Tb12, elektroforesis and visualization with UV-transilluminator and sequencing. Amplification result showed a specific DNA band with length of 441 bp. The amplification product was succesfully sequenced. The sequence was analyzed using BLAST and phylogenetic analysis. The results showed 100% similarity of the gene sequence with hsp65 gene sequence of Nocardia seriolae (DQ431454.1), and 93-99% with other Nocardia species. Phylogenetic result indicated pathogenic bacteria studied in this work was in the branch of Nocardia seriolae species. |
Kata Kunci | Identifikasi Molekuler, Bakteri Pathogen, Gen hsp65, Gurami. |
Nama Pembimbing 1 | Dr. rer. nat. Hamdan Syakuri, S. Pi, M. Si |
Nama Pembimbing 2 | Dewi Nugrayani, S. Pt, M. Sc |
Tahun | 2017 |
Jumlah Halaman | 14 |
Page generated in 0.0534 seconds.