View Artikel Ilmiah
Kembali| NIM (Student Number) | A1D015200 |
|---|---|
| Nama Mahasiswa | SHOFWAN AKBAR MUHAMMAD |
| Judul Artikel | BIOASAI ISOLAT BAKTERI POTENSIAL PROBIOTIK TERHADAP PERKECAMBAHAN VARIETAS PADI LAHAN MARGINAL (GOGO) DAN IDENTIFIKASI SECARA MOLEKULER16S rRNA |
| Abstrak | Penelitian ini bertujuan: 1) Mengetahui respon perkecambahan benih tanaman padi lahan marginal (gogo) setelah pemberian perlakuan isolat bakteri potensial probiotik dan 2) Mengetahui identitas tingkat spesies dari isolat bakteri potensial probiotik menggunakan metode uji molekuler 16S rRNA. Penelitian dilakukan menggunakan uji bioasai berupa pemberian 5 isolat bakteri (SR1, GT2, SW1, PA1, dan TS4) pada tiga varietas padi (Inpago Unsoed, Unsoed Parimas, dan Inpago 8). Daya berkecambah, potensi tumbuh maksimum, kecepatan tumbuh, bobot kering kecambah normal, indeks vigor, dan keserampakan tumbuh merupakan variabel yang diamati. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa pemberian isolat bakteri berpengaruh nyata terhadap variabel kecepatan tumbuh benih padi. Varietas padi juga memiliki pengaruh yang nyata terhadap variabel PTM dan Keserampakan tumbuh, serta sangat nyata terhadap keempat variabel lainnya. Identifikasi isolat bakteri dilakukan dengan menggunakan metode molekuler 16S rRNA yang hasil sekuensingnya dimasukan kedalam program BLAST pada NCBI. Hasil yang diperoleh menunjukan bahwa isolat bakteri SW1, TS4 dan PA1 berturut-turut memiliki similarity dengan Bacillus tropicus strain MCCC 1a01406, Bacillus subtilis strain DSM 10, dan Acidovorax delafieldi strain 133. Analisis dilanjutkan dengan melihat hubungan filogenetik menggunakan metode neighbor joining tree. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa masing-masing isolat bakteri memiliki hubungan kekerabatan sesuai hasil BLAST dengan nilai similarity tertinggi. |
| Abstrak (Inggris) | This research is conducted for: 1) Knowing the germination response of marginal type rice seeds (Gogo Rice Seeds) after the application of potential probiotic bacteria 2) Knowing the identity (species level) of the potential probiotic bacteria using molecular test 16S rRNA method. Research conducted by bioassay method using 5 bacteria isolates (SR1, GT2, SW1, PA1, dan TS4) applied to 3 different variety of rice plant (Inpago Unsoed, Unsoed Parimas, dan Inpago 8). Seed germination, potential maximum growth, growth speed, weight of normal dry seed, vigor index, and simultanious growth is observed. The result is that the application of probiotic bacteria showed significant different values for growth speed of rice seeds. The variety of seeds showed significantly different values for max potential growth and simultanious growth, whereas it showed very significant different values for the other 4 variables. Identification of bacteria isolate using 16S rRNA method with the result of sequencing is processed with BLAST program on NCBI. Isolate bacteria SW1, TS4 and PA1 showed similarity as Bacillus tropicus MCCC 1a01406 strain, Bacillus subtilis DSM 10 strain, and Acidovorax delafieldi 133 strain. Analysis continue by observing filogenetic connection using Neighbor Joining Method. Result showed that each bacteria has connection of identity as shown with BLAST with highest similarity. |
| Kata Kunci | Probiotik, Bioasai, Kecepatan Tumbuh Benih, Filogeni, 16S rRNA |
| Nama Pembimbing 1 | Sapto Nugroho Hadi, S.Si., M.Biotech |
| Nama Pembimbing 2 | Prita Sari Dewi, SP., M.Sc., Ph.D |
| Tahun | 2022 |
| Jumlah Halaman | 9 |
Page generated in 0.0712 seconds.